Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Urb1Q571H0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Urb1Q571H0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Urb1Q571H0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Urb1Q571H0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Urb1Q571H0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Urb1Q571H0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Urb1Q571H0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Urb1Q571H0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Urb1Q571H0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Urb1Q571H0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Urb1Q571H0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Urb1Q571H0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Urb1Q571H0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Urb1Q571H0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Urb1Q571H0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb1Q571H0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb1Q571H0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Urb1Q571H0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Urb1Q571H0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Urb1Q571H0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Urb1Q571H0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Urb1Q571H0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb1Q571H0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb1Q571H0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Urb1Q571H0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Urb1Q571H0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Urb1Q571H0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Urb1Q571H0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Urb1Q571H0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Urb1Q571H0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Urb1Q571H0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Urb1Q571H0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Urb1Q571H0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb1Q571H0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb1Q571H0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Urb1Q571H0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb1Q571H0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb1Q571H0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb1Q571H0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb1Q571H0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Urb1Q571H0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Urb1Q571H0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Urb1Q571H0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Urb1Q571H0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Urb1Q571H0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Urb1Q571H0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Urb1Q571H0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Urb1Q571H0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Urb1Q571H0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Urb1Q571H0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Urb1Q571H0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Urb1Q571H0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Urb1Q571H0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Urb1Q571H0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb1Q571H0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb1Q571H0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb1Q571H0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb1Q571H0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb1Q571H0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb1Q571H0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Urb1Q571H0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb1Q571H0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb1Q571H0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb1Q571H0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Urb1Q571H0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
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