Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Srbd1Q497V5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srbd1Q497V5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Srbd1Q497V5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srbd1Q497V5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Srbd1Q497V5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Srbd1Q497V5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Srbd1Q497V5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srbd1Q497V5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srbd1Q497V5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srbd1Q497V5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Srbd1Q497V5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Srbd1Q497V5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srbd1Q497V5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srbd1Q497V5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Srbd1Q497V5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srbd1Q497V5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srbd1Q497V5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srbd1Q497V5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srbd1Q497V5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srbd1Q497V5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srbd1Q497V5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srbd1Q497V5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srbd1Q497V5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srbd1Q497V5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srbd1Q497V5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srbd1Q497V5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srbd1Q497V5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Srbd1Q497V5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srbd1Q497V5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srbd1Q497V5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srbd1Q497V5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srbd1Q497V5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srbd1Q497V5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srbd1Q497V5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srbd1Q497V5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srbd1Q497V5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srbd1Q497V5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srbd1Q497V5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Srbd1Q497V5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srbd1Q497V5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srbd1Q497V5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srbd1Q497V5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srbd1Q497V5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srbd1Q497V5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srbd1Q497V5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srbd1Q497V5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srbd1Q497V5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Srbd1Q497V5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srbd1Q497V5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srbd1Q497V5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srbd1Q497V5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srbd1Q497V5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Srbd1Q497V5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srbd1Q497V5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srbd1Q497V5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srbd1Q497V5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srbd1Q497V5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Srbd1Q497V5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srbd1Q497V5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srbd1Q497V5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srbd1Q497V5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srbd1Q497V5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Srbd1Q497V5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srbd1Q497V5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srbd1Q497V5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Srbd1Q497V5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Srbd1Q497V5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srbd1Q497V5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms