Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Krtap1-4Q3V2D6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Krtap1-4Q3V2D6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Krtap1-4Q3V2D6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Krtap1-4Q3V2D6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Krtap1-4Q3V2D6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Krtap1-4Q3V2D6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Krtap1-4Q3V2D6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Krtap1-4Q3V2D6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Krtap1-4Q3V2D6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Krtap1-4Q3V2D6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Krtap1-4Q3V2D6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Krtap1-4Q3V2D6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Krtap1-4Q3V2D6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Krtap1-4Q3V2D6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Krtap1-4Q3V2D6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Krtap1-4Q3V2D6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Krtap1-4Q3V2D6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Krtap1-4Q3V2D6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Krtap1-4Q3V2D6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Krtap1-4Q3V2D6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Krtap1-4Q3V2D6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms