Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
4930596D02RikQ3V0H9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4930596D02RikQ3V0H9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
4930596D02RikQ3V0H9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
4930596D02RikQ3V0H9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms