Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV9

Ncbp1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp1Q3UYV9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ncbp1Q3UYV9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ncbp1Q3UYV9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ncbp1Q3UYV9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncbp1Q3UYV9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ncbp1Q3UYV9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncbp1Q3UYV9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ncbp1Q3UYV9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ncbp1Q3UYV9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncbp1Q3UYV9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncbp1Q3UYV9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncbp1Q3UYV9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ncbp1Q3UYV9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ncbp1Q3UYV9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncbp1Q3UYV9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncbp1Q3UYV9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ncbp1Q3UYV9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ncbp1Q3UYV9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ncbp1Q3UYV9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncbp1Q3UYV9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ncbp1Q3UYV9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncbp1Q3UYV9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncbp1Q3UYV9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ncbp1Q3UYV9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncbp1Q3UYV9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncbp1Q3UYV9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncbp1Q3UYV9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncbp1Q3UYV9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncbp1Q3UYV9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ncbp1Q3UYV9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncbp1Q3UYV9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ncbp1Q3UYV9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncbp1Q3UYV9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ncbp1Q3UYV9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ncbp1Q3UYV9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ncbp1Q3UYV9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncbp1Q3UYV9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ncbp1Q3UYV9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncbp1Q3UYV9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ncbp1Q3UYV9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncbp1Q3UYV9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncbp1Q3UYV9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncbp1Q3UYV9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ncbp1Q3UYV9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ncbp1Q3UYV9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncbp1Q3UYV9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncbp1Q3UYV9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ncbp1Q3UYV9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncbp1Q3UYV9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ncbp1Q3UYV9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ncbp1Q3UYV9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ncbp1Q3UYV9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ncbp1Q3UYV9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ncbp1Q3UYV9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ncbp1Q3UYV9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncbp1Q3UYV9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncbp1Q3UYV9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncbp1Q3UYV9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncbp1Q3UYV9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ncbp1Q3UYV9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncbp1Q3UYV9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ncbp1Q3UYV9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ncbp1Q3UYV9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ncbp1Q3UYV9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ncbp1Q3UYV9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ncbp1Q3UYV9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ncbp1Q3UYV9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ncbp1Q3UYV9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ncbp1Q3UYV9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ncbp1Q3UYV9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ncbp1Q3UYV9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ncbp1Q3UYV9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncbp1Q3UYV9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncbp1Q3UYV9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncbp1Q3UYV9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ncbp1Q3UYV9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ncbp1Q3UYV9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms