Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Capn13Q3UW68 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Capn13Q3UW68 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Capn13Q3UW68 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Capn13Q3UW68 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Capn13Q3UW68 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Capn13Q3UW68 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Capn13Q3UW68 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Capn13Q3UW68 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Capn13Q3UW68 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Capn13Q3UW68 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Capn13Q3UW68 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Capn13Q3UW68 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Capn13Q3UW68 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Capn13Q3UW68 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Capn13Q3UW68 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Capn13Q3UW68 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Capn13Q3UW68 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Capn13Q3UW68 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Capn13Q3UW68 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Capn13Q3UW68 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Capn13Q3UW68 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Capn13Q3UW68 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Capn13Q3UW68 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Capn13Q3UW68 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Capn13Q3UW68 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Capn13Q3UW68 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Capn13Q3UW68 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Capn13Q3UW68 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Capn13Q3UW68 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Capn13Q3UW68 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Capn13Q3UW68 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Capn13Q3UW68 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Capn13Q3UW68 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Capn13Q3UW68 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Capn13Q3UW68 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Capn13Q3UW68 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Capn13Q3UW68 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Capn13Q3UW68 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Capn13Q3UW68 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Capn13Q3UW68 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Capn13Q3UW68 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Capn13Q3UW68 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Capn13Q3UW68 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Capn13Q3UW68 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Capn13Q3UW68 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Capn13Q3UW68 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Capn13Q3UW68 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Capn13Q3UW68 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Capn13Q3UW68 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Capn13Q3UW68 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Capn13Q3UW68 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Capn13Q3UW68 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Capn13Q3UW68 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Capn13Q3UW68 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Capn13Q3UW68 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Capn13Q3UW68 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Capn13Q3UW68 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Capn13Q3UW68 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Capn13Q3UW68 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Capn13Q3UW68 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Capn13Q3UW68 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Capn13Q3UW68 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Capn13Q3UW68 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Capn13Q3UW68 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Capn13Q3UW68 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Capn13Q3UW68 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Capn13Q3UW68 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Capn13Q3UW68 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Capn13Q3UW68 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Capn13Q3UW68 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Capn13Q3UW68 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Capn13Q3UW68 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Capn13Q3UW68 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Capn13Q3UW68 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Capn13Q3UW68 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Capn13Q3UW68 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Capn13Q3UW68 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Capn13Q3UW68 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Capn13Q3UW68 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Capn13Q3UW68 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Capn13Q3UW68 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Capn13Q3UW68 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Capn13Q3UW68 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Capn13Q3UW68 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Capn13Q3UW68 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Capn13Q3UW68 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Capn13Q3UW68 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Capn13Q3UW68 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Capn13Q3UW68 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Capn13Q3UW68 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Capn13Q3UW68 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Capn13Q3UW68 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms