Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rtl4Q3URY0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rtl4Q3URY0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rtl4Q3URY0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rtl4Q3URY0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms