Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccdc190Q3URK1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc190Q3URK1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc190Q3URK1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc190Q3URK1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc190Q3URK1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc190Q3URK1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc190Q3URK1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc190Q3URK1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc190Q3URK1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc190Q3URK1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc190Q3URK1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc190Q3URK1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc190Q3URK1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc190Q3URK1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc190Q3URK1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc190Q3URK1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc190Q3URK1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc190Q3URK1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc190Q3URK1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc190Q3URK1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc190Q3URK1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc190Q3URK1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc190Q3URK1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms