Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx21Q3UR97 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx21Q3UR97 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Snx21Q3UR97 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snx21Q3UR97 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx21Q3UR97 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx21Q3UR97 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx21Q3UR97 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx21Q3UR97 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx21Q3UR97 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx21Q3UR97 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx21Q3UR97 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snx21Q3UR97 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx21Q3UR97 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snx21Q3UR97 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx21Q3UR97 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx21Q3UR97 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snx21Q3UR97 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx21Q3UR97 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx21Q3UR97 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx21Q3UR97 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snx21Q3UR97 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx21Q3UR97 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx21Q3UR97 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx21Q3UR97 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx21Q3UR97 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx21Q3UR97 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snx21Q3UR97 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx21Q3UR97 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx21Q3UR97 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx21Q3UR97 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snx21Q3UR97 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx21Q3UR97 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx21Q3UR97 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snx21Q3UR97 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snx21Q3UR97 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snx21Q3UR97 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx21Q3UR97 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx21Q3UR97 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx21Q3UR97 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx21Q3UR97 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx21Q3UR97 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snx21Q3UR97 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx21Q3UR97 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx21Q3UR97 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx21Q3UR97 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx21Q3UR97 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx21Q3UR97 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx21Q3UR97 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx21Q3UR97 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx21Q3UR97 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx21Q3UR97 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx21Q3UR97 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx21Q3UR97 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snx21Q3UR97 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx21Q3UR97 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snx21Q3UR97 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx21Q3UR97 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snx21Q3UR97 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx21Q3UR97 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx21Q3UR97 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx21Q3UR97 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx21Q3UR97 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx21Q3UR97 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snx21Q3UR97 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx21Q3UR97 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx21Q3UR97 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx21Q3UR97 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx21Q3UR97 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx21Q3UR97 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snx21Q3UR97 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx21Q3UR97 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx21Q3UR97 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Snx21Q3UR97 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx21Q3UR97 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx21Q3UR97 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx21Q3UR97 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx21Q3UR97 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx21Q3UR97 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Snx21Q3UR97 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx21Q3UR97 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Snx21Q3UR97 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx21Q3UR97 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx21Q3UR97 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx21Q3UR97 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx21Q3UR97 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx21Q3UR97 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx21Q3UR97 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx21Q3UR97 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx21Q3UR97 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx21Q3UR97 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx21Q3UR97 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx21Q3UR97 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx21Q3UR97 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx21Q3UR97 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx21Q3UR97 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx21Q3UR97 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx21Q3UR97 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx21Q3UR97 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx21Q3UR97 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms