Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQS8

Rbm20, RNA-binding protein 20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm20Q3UQS8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm20Q3UQS8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm20Q3UQS8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rbm20Q3UQS8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm20Q3UQS8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm20Q3UQS8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rbm20Q3UQS8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm20Q3UQS8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm20Q3UQS8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm20Q3UQS8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rbm20Q3UQS8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rbm20Q3UQS8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbm20Q3UQS8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbm20Q3UQS8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm20Q3UQS8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbm20Q3UQS8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm20Q3UQS8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm20Q3UQS8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbm20Q3UQS8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbm20Q3UQS8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbm20Q3UQS8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm20Q3UQS8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm20Q3UQS8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm20Q3UQS8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbm20Q3UQS8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm20Q3UQS8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm20Q3UQS8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm20Q3UQS8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm20Q3UQS8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm20Q3UQS8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbm20Q3UQS8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm20Q3UQS8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm20Q3UQS8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm20Q3UQS8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm20Q3UQS8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm20Q3UQS8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm20Q3UQS8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm20Q3UQS8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm20Q3UQS8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm20Q3UQS8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm20Q3UQS8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm20Q3UQS8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm20Q3UQS8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm20Q3UQS8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rbm20Q3UQS8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm20Q3UQS8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm20Q3UQS8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm20Q3UQS8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm20Q3UQS8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm20Q3UQS8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm20Q3UQS8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbm20Q3UQS8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbm20Q3UQS8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbm20Q3UQS8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbm20Q3UQS8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbm20Q3UQS8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbm20Q3UQS8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rbm20Q3UQS8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rbm20Q3UQS8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rbm20Q3UQS8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbm20Q3UQS8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbm20Q3UQS8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbm20Q3UQS8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbm20Q3UQS8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbm20Q3UQS8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbm20Q3UQS8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbm20Q3UQS8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rbm20Q3UQS8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbm20Q3UQS8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbm20Q3UQS8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbm20Q3UQS8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rbm20Q3UQS8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rbm20Q3UQS8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbm20Q3UQS8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rbm20Q3UQS8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbm20Q3UQS8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbm20Q3UQS8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbm20Q3UQS8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbm20Q3UQS8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rbm20Q3UQS8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbm20Q3UQS8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbm20Q3UQS8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbm20Q3UQS8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rbm20Q3UQS8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rbm20Q3UQS8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rbm20Q3UQS8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rbm20Q3UQS8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbm20Q3UQS8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbm20Q3UQS8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rbm20Q3UQS8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rbm20Q3UQS8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rbm20Q3UQS8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rbm20Q3UQS8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rbm20Q3UQS8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rbm20Q3UQS8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbm20Q3UQS8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbm20Q3UQS8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbm20Q3UQS8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rbm20Q3UQS8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rbm20Q3UQS8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms