Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPF5

Zc3hav1, Zinc finger CCCH-type antiviral protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3hav1Q3UPF5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3hav1Q3UPF5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zc3hav1Q3UPF5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zc3hav1Q3UPF5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3hav1Q3UPF5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3hav1Q3UPF5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zc3hav1Q3UPF5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3hav1Q3UPF5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3hav1Q3UPF5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3hav1Q3UPF5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zc3hav1Q3UPF5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zc3hav1Q3UPF5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zc3hav1Q3UPF5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zc3hav1Q3UPF5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms