Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmem35bQ3U0Y2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tmem35bQ3U0Y2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem35bQ3U0Y2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem35bQ3U0Y2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem35bQ3U0Y2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem35bQ3U0Y2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmem35bQ3U0Y2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem35bQ3U0Y2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmem35bQ3U0Y2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem35bQ3U0Y2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem35bQ3U0Y2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tmem35bQ3U0Y2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem35bQ3U0Y2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem35bQ3U0Y2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem35bQ3U0Y2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem35bQ3U0Y2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem35bQ3U0Y2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem35bQ3U0Y2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem35bQ3U0Y2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem35bQ3U0Y2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem35bQ3U0Y2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem35bQ3U0Y2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem35bQ3U0Y2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem35bQ3U0Y2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem35bQ3U0Y2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem35bQ3U0Y2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem35bQ3U0Y2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem35bQ3U0Y2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem35bQ3U0Y2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem35bQ3U0Y2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem35bQ3U0Y2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem35bQ3U0Y2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem35bQ3U0Y2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem35bQ3U0Y2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem35bQ3U0Y2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem35bQ3U0Y2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem35bQ3U0Y2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem35bQ3U0Y2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem35bQ3U0Y2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem35bQ3U0Y2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem35bQ3U0Y2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem35bQ3U0Y2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem35bQ3U0Y2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem35bQ3U0Y2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem35bQ3U0Y2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem35bQ3U0Y2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem35bQ3U0Y2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem35bQ3U0Y2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tmem35bQ3U0Y2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem35bQ3U0Y2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem35bQ3U0Y2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem35bQ3U0Y2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem35bQ3U0Y2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem35bQ3U0Y2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem35bQ3U0Y2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem35bQ3U0Y2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem35bQ3U0Y2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem35bQ3U0Y2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem35bQ3U0Y2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem35bQ3U0Y2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem35bQ3U0Y2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem35bQ3U0Y2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem35bQ3U0Y2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem35bQ3U0Y2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmem35bQ3U0Y2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem35bQ3U0Y2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem35bQ3U0Y2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem35bQ3U0Y2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem35bQ3U0Y2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem35bQ3U0Y2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem35bQ3U0Y2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem35bQ3U0Y2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem35bQ3U0Y2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem35bQ3U0Y2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem35bQ3U0Y2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem35bQ3U0Y2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmem35bQ3U0Y2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmem35bQ3U0Y2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmem35bQ3U0Y2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem35bQ3U0Y2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem35bQ3U0Y2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem35bQ3U0Y2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem35bQ3U0Y2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem35bQ3U0Y2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem35bQ3U0Y2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem35bQ3U0Y2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem35bQ3U0Y2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem35bQ3U0Y2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem35bQ3U0Y2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem35bQ3U0Y2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem35bQ3U0Y2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms