Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrn4clQ3TYX2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrn4clQ3TYX2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrn4clQ3TYX2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrn4clQ3TYX2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrn4clQ3TYX2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrn4clQ3TYX2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrn4clQ3TYX2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrn4clQ3TYX2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrn4clQ3TYX2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrn4clQ3TYX2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrn4clQ3TYX2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrn4clQ3TYX2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrn4clQ3TYX2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrn4clQ3TYX2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrn4clQ3TYX2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrn4clQ3TYX2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrn4clQ3TYX2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrrn4clQ3TYX2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrn4clQ3TYX2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrn4clQ3TYX2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrn4clQ3TYX2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrn4clQ3TYX2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrn4clQ3TYX2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrn4clQ3TYX2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrn4clQ3TYX2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrn4clQ3TYX2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrn4clQ3TYX2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrn4clQ3TYX2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrn4clQ3TYX2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrn4clQ3TYX2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrn4clQ3TYX2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrn4clQ3TYX2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrn4clQ3TYX2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrn4clQ3TYX2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrn4clQ3TYX2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrn4clQ3TYX2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrn4clQ3TYX2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrn4clQ3TYX2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrn4clQ3TYX2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrn4clQ3TYX2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrn4clQ3TYX2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrn4clQ3TYX2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn4clQ3TYX2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn4clQ3TYX2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn4clQ3TYX2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrn4clQ3TYX2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms