Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc28Q3TX51 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc28Q3TX51 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc28Q3TX51 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc28Q3TX51 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lrrc28Q3TX51 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc28Q3TX51 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrrc28Q3TX51 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc28Q3TX51 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrrc28Q3TX51 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc28Q3TX51 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc28Q3TX51 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc28Q3TX51 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrrc28Q3TX51 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc28Q3TX51 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc28Q3TX51 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc28Q3TX51 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrrc28Q3TX51 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrrc28Q3TX51 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc28Q3TX51 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc28Q3TX51 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc28Q3TX51 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc28Q3TX51 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrrc28Q3TX51 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc28Q3TX51 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc28Q3TX51 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc28Q3TX51 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrrc28Q3TX51 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc28Q3TX51 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc28Q3TX51 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc28Q3TX51 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc28Q3TX51 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc28Q3TX51 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc28Q3TX51 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrrc28Q3TX51 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc28Q3TX51 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc28Q3TX51 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrrc28Q3TX51 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc28Q3TX51 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc28Q3TX51 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc28Q3TX51 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc28Q3TX51 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc28Q3TX51 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc28Q3TX51 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc28Q3TX51 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc28Q3TX51 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc28Q3TX51 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc28Q3TX51 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc28Q3TX51 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc28Q3TX51 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc28Q3TX51 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc28Q3TX51 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc28Q3TX51 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc28Q3TX51 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc28Q3TX51 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc28Q3TX51 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc28Q3TX51 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrrc28Q3TX51 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc28Q3TX51 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc28Q3TX51 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrrc28Q3TX51 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc28Q3TX51 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc28Q3TX51 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc28Q3TX51 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc28Q3TX51 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc28Q3TX51 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc28Q3TX51 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrrc28Q3TX51 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc28Q3TX51 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrrc28Q3TX51 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrrc28Q3TX51 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms