Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trmt1Q3TX08 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Trmt1Q3TX08 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trmt1Q3TX08 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trmt1Q3TX08 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Trmt1Q3TX08 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Trmt1Q3TX08 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trmt1Q3TX08 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Trmt1Q3TX08 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Trmt1Q3TX08 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trmt1Q3TX08 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Trmt1Q3TX08 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trmt1Q3TX08 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Trmt1Q3TX08 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trmt1Q3TX08 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trmt1Q3TX08 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trmt1Q3TX08 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trmt1Q3TX08 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trmt1Q3TX08 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trmt1Q3TX08 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trmt1Q3TX08 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trmt1Q3TX08 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trmt1Q3TX08 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trmt1Q3TX08 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trmt1Q3TX08 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trmt1Q3TX08 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Trmt1Q3TX08 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trmt1Q3TX08 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trmt1Q3TX08 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trmt1Q3TX08 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trmt1Q3TX08 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trmt1Q3TX08 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trmt1Q3TX08 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trmt1Q3TX08 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trmt1Q3TX08 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trmt1Q3TX08 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Trmt1Q3TX08 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trmt1Q3TX08 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trmt1Q3TX08 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trmt1Q3TX08 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trmt1Q3TX08 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trmt1Q3TX08 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trmt1Q3TX08 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trmt1Q3TX08 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Trmt1Q3TX08 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trmt1Q3TX08 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trmt1Q3TX08 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trmt1Q3TX08 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trmt1Q3TX08 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trmt1Q3TX08 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trmt1Q3TX08 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trmt1Q3TX08 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trmt1Q3TX08 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Trmt1Q3TX08 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Trmt1Q3TX08 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trmt1Q3TX08 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trmt1Q3TX08 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trmt1Q3TX08 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trmt1Q3TX08 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trmt1Q3TX08 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trmt1Q3TX08 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Trmt1Q3TX08 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Trmt1Q3TX08 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trmt1Q3TX08 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Trmt1Q3TX08 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trmt1Q3TX08 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trmt1Q3TX08 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trmt1Q3TX08 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trmt1Q3TX08 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Trmt1Q3TX08 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trmt1Q3TX08 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trmt1Q3TX08 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trmt1Q3TX08 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trmt1Q3TX08 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trmt1Q3TX08 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trmt1Q3TX08 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trmt1Q3TX08 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trmt1Q3TX08 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trmt1Q3TX08 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trmt1Q3TX08 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trmt1Q3TX08 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trmt1Q3TX08 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trmt1Q3TX08 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trmt1Q3TX08 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trmt1Q3TX08 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trmt1Q3TX08 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trmt1Q3TX08 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trmt1Q3TX08 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trmt1Q3TX08 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trmt1Q3TX08 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trmt1Q3TX08 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trmt1Q3TX08 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trmt1Q3TX08 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trmt1Q3TX08 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trmt1Q3TX08 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trmt1Q3TX08 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trmt1Q3TX08 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Trmt1Q3TX08 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Trmt1Q3TX08 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trmt1Q3TX08 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 253.5 ms