Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLS3

Gdpgp1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpgp1Q3TLS3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gdpgp1Q3TLS3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gdpgp1Q3TLS3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gdpgp1Q3TLS3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gdpgp1Q3TLS3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdpgp1Q3TLS3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gdpgp1Q3TLS3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdpgp1Q3TLS3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gdpgp1Q3TLS3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gdpgp1Q3TLS3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gdpgp1Q3TLS3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gdpgp1Q3TLS3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gdpgp1Q3TLS3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdpgp1Q3TLS3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdpgp1Q3TLS3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gdpgp1Q3TLS3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gdpgp1Q3TLS3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gdpgp1Q3TLS3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms