Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Uri1Q3TLD5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Uri1Q3TLD5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Uri1Q3TLD5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uri1Q3TLD5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uri1Q3TLD5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uri1Q3TLD5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uri1Q3TLD5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Uri1Q3TLD5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uri1Q3TLD5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uri1Q3TLD5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uri1Q3TLD5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Uri1Q3TLD5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Uri1Q3TLD5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uri1Q3TLD5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uri1Q3TLD5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Uri1Q3TLD5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uri1Q3TLD5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uri1Q3TLD5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Uri1Q3TLD5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Uri1Q3TLD5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Uri1Q3TLD5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uri1Q3TLD5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uri1Q3TLD5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Uri1Q3TLD5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uri1Q3TLD5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Uri1Q3TLD5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uri1Q3TLD5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uri1Q3TLD5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Uri1Q3TLD5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Uri1Q3TLD5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uri1Q3TLD5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Uri1Q3TLD5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uri1Q3TLD5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uri1Q3TLD5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Uri1Q3TLD5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uri1Q3TLD5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Uri1Q3TLD5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uri1Q3TLD5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uri1Q3TLD5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Uri1Q3TLD5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Uri1Q3TLD5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Uri1Q3TLD5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Uri1Q3TLD5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Uri1Q3TLD5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Uri1Q3TLD5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Uri1Q3TLD5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Uri1Q3TLD5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uri1Q3TLD5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Uri1Q3TLD5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.6 ms