Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim43aQ3TL54 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim43aQ3TL54 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim43aQ3TL54 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim43aQ3TL54 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim43aQ3TL54 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim43aQ3TL54 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim43aQ3TL54 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim43aQ3TL54 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim43aQ3TL54 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim43aQ3TL54 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim43aQ3TL54 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim43aQ3TL54 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim43aQ3TL54 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim43aQ3TL54 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim43aQ3TL54 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim43aQ3TL54 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim43aQ3TL54 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim43aQ3TL54 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim43aQ3TL54 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim43aQ3TL54 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim43aQ3TL54 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim43aQ3TL54 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim43aQ3TL54 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim43aQ3TL54 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim43aQ3TL54 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim43aQ3TL54 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim43aQ3TL54 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim43aQ3TL54 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim43aQ3TL54 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim43aQ3TL54 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim43aQ3TL54 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim43aQ3TL54 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim43aQ3TL54 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim43aQ3TL54 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim43aQ3TL54 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim43aQ3TL54 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim43aQ3TL54 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim43aQ3TL54 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim43aQ3TL54 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim43aQ3TL54 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim43aQ3TL54 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim43aQ3TL54 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim43aQ3TL54 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim43aQ3TL54 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim43aQ3TL54 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim43aQ3TL54 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim43aQ3TL54 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim43aQ3TL54 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim43aQ3TL54 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim43aQ3TL54 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim43aQ3TL54 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms