Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc13Q3TIR1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc13Q3TIR1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc13Q3TIR1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc13Q3TIR1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trappc13Q3TIR1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trappc13Q3TIR1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc13Q3TIR1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc13Q3TIR1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc13Q3TIR1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc13Q3TIR1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc13Q3TIR1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc13Q3TIR1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc13Q3TIR1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc13Q3TIR1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trappc13Q3TIR1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc13Q3TIR1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trappc13Q3TIR1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc13Q3TIR1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc13Q3TIR1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trappc13Q3TIR1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trappc13Q3TIR1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc13Q3TIR1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trappc13Q3TIR1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc13Q3TIR1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc13Q3TIR1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc13Q3TIR1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc13Q3TIR1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc13Q3TIR1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc13Q3TIR1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc13Q3TIR1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc13Q3TIR1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc13Q3TIR1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc13Q3TIR1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc13Q3TIR1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc13Q3TIR1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc13Q3TIR1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc13Q3TIR1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc13Q3TIR1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc13Q3TIR1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc13Q3TIR1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc13Q3TIR1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc13Q3TIR1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc13Q3TIR1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc13Q3TIR1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trappc13Q3TIR1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trappc13Q3TIR1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc13Q3TIR1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Trappc13Q3TIR1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc13Q3TIR1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc13Q3TIR1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc13Q3TIR1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trappc13Q3TIR1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc13Q3TIR1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc13Q3TIR1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc13Q3TIR1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Trappc13Q3TIR1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc13Q3TIR1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Trappc13Q3TIR1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Trappc13Q3TIR1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc13Q3TIR1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Trappc13Q3TIR1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc13Q3TIR1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc13Q3TIR1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc13Q3TIR1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc13Q3TIR1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc13Q3TIR1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc13Q3TIR1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Trappc13Q3TIR1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc13Q3TIR1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc13Q3TIR1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc13Q3TIR1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc13Q3TIR1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trappc13Q3TIR1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trappc13Q3TIR1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms