Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prr27Q3SYJ2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prr27Q3SYJ2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Prr27Q3SYJ2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Prr27Q3SYJ2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Prr27Q3SYJ2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prr27Q3SYJ2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prr27Q3SYJ2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prr27Q3SYJ2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prr27Q3SYJ2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr27Q3SYJ2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr27Q3SYJ2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr27Q3SYJ2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr27Q3SYJ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr27Q3SYJ2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prr27Q3SYJ2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr27Q3SYJ2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr27Q3SYJ2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prr27Q3SYJ2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Prr27Q3SYJ2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prr27Q3SYJ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Prr27Q3SYJ2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr27Q3SYJ2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr27Q3SYJ2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Prr27Q3SYJ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms