Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hddc2Q3SXD3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hddc2Q3SXD3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hddc2Q3SXD3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hddc2Q3SXD3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hddc2Q3SXD3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms