Protein–RNA interactions for Protein: Q3I5G5

Foxi2, Forkhead box protein I2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxi2Q3I5G5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxi2Q3I5G5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxi2Q3I5G5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxi2Q3I5G5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxi2Q3I5G5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxi2Q3I5G5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Foxi2Q3I5G5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxi2Q3I5G5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxi2Q3I5G5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxi2Q3I5G5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxi2Q3I5G5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxi2Q3I5G5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxi2Q3I5G5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Foxi2Q3I5G5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxi2Q3I5G5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxi2Q3I5G5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxi2Q3I5G5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxi2Q3I5G5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxi2Q3I5G5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Foxi2Q3I5G5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxi2Q3I5G5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Foxi2Q3I5G5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxi2Q3I5G5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms