Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPA6

Helq, Helicase POLQ-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelqQ2VPA6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HelqQ2VPA6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HelqQ2VPA6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HelqQ2VPA6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HelqQ2VPA6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HelqQ2VPA6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HelqQ2VPA6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HelqQ2VPA6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HelqQ2VPA6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HelqQ2VPA6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HelqQ2VPA6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HelqQ2VPA6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HelqQ2VPA6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HelqQ2VPA6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HelqQ2VPA6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HelqQ2VPA6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HelqQ2VPA6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HelqQ2VPA6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HelqQ2VPA6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HelqQ2VPA6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HelqQ2VPA6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HelqQ2VPA6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HelqQ2VPA6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HelqQ2VPA6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HelqQ2VPA6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HelqQ2VPA6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HelqQ2VPA6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HelqQ2VPA6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HelqQ2VPA6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HelqQ2VPA6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HelqQ2VPA6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HelqQ2VPA6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HelqQ2VPA6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HelqQ2VPA6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HelqQ2VPA6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HelqQ2VPA6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HelqQ2VPA6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HelqQ2VPA6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HelqQ2VPA6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HelqQ2VPA6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HelqQ2VPA6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HelqQ2VPA6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HelqQ2VPA6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HelqQ2VPA6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HelqQ2VPA6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HelqQ2VPA6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HelqQ2VPA6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HelqQ2VPA6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HelqQ2VPA6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HelqQ2VPA6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HelqQ2VPA6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HelqQ2VPA6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HelqQ2VPA6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HelqQ2VPA6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HelqQ2VPA6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HelqQ2VPA6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HelqQ2VPA6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HelqQ2VPA6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HelqQ2VPA6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms