Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp8Q2V6D6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp8Q2V6D6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp8Q2V6D6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp8Q2V6D6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp8Q2V6D6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp8Q2V6D6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp8Q2V6D6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp8Q2V6D6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp8Q2V6D6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gbp8Q2V6D6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gbp8Q2V6D6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gbp8Q2V6D6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gbp8Q2V6D6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp8Q2V6D6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp8Q2V6D6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp8Q2V6D6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp8Q2V6D6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp8Q2V6D6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp8Q2V6D6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbp8Q2V6D6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gbp8Q2V6D6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gbp8Q2V6D6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gbp8Q2V6D6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gbp8Q2V6D6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gbp8Q2V6D6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbp8Q2V6D6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbp8Q2V6D6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbp8Q2V6D6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gbp8Q2V6D6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gbp8Q2V6D6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gbp8Q2V6D6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gbp8Q2V6D6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbp8Q2V6D6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbp8Q2V6D6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbp8Q2V6D6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbp8Q2V6D6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbp8Q2V6D6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gbp8Q2V6D6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gbp8Q2V6D6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gbp8Q2V6D6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gbp8Q2V6D6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gbp8Q2V6D6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp8Q2V6D6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp8Q2V6D6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp8Q2V6D6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp8Q2V6D6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp8Q2V6D6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp8Q2V6D6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp8Q2V6D6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp8Q2V6D6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp8Q2V6D6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp8Q2V6D6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp8Q2V6D6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp8Q2V6D6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp8Q2V6D6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp8Q2V6D6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp8Q2V6D6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp8Q2V6D6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp8Q2V6D6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp8Q2V6D6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp8Q2V6D6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp8Q2V6D6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp8Q2V6D6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gbp8Q2V6D6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp8Q2V6D6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp8Q2V6D6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp8Q2V6D6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gbp8Q2V6D6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp8Q2V6D6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp8Q2V6D6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp8Q2V6D6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp8Q2V6D6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp8Q2V6D6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp8Q2V6D6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp8Q2V6D6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp8Q2V6D6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp8Q2V6D6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp8Q2V6D6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp8Q2V6D6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gbp8Q2V6D6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gbp8Q2V6D6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gbp8Q2V6D6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbp8Q2V6D6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbp8Q2V6D6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbp8Q2V6D6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbp8Q2V6D6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbp8Q2V6D6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbp8Q2V6D6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gbp8Q2V6D6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp8Q2V6D6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp8Q2V6D6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp8Q2V6D6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gbp8Q2V6D6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp8Q2V6D6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp8Q2V6D6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp8Q2V6D6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp8Q2V6D6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbp8Q2V6D6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbp8Q2V6D6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.6 ms