Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

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Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
Shroom4Q1W617 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
Shroom4Q1W617 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
Shroom4Q1W617 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
Shroom4Q1W617 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Shroom4Q1W617 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Shroom4Q1W617 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Shroom4Q1W617 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Shroom4Q1W617 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Shroom4Q1W617 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Shroom4Q1W617 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
Shroom4Q1W617 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Shroom4Q1W617 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Shroom4Q1W617 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Shroom4Q1W617 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
Shroom4Q1W617 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Shroom4Q1W617 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Shroom4Q1W617 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Shroom4Q1W617 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Shroom4Q1W617 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Shroom4Q1W617 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Shroom4Q1W617 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
Shroom4Q1W617 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
Shroom4Q1W617 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Shroom4Q1W617 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Shroom4Q1W617 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Shroom4Q1W617 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Shroom4Q1W617 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Shroom4Q1W617 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Shroom4Q1W617 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Shroom4Q1W617 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Shroom4Q1W617 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Shroom4Q1W617 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Shroom4Q1W617 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Shroom4Q1W617 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Shroom4Q1W617 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Shroom4Q1W617 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Shroom4Q1W617 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Shroom4Q1W617 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
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