Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptcd3Q14C51 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptcd3Q14C51 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ptcd3Q14C51 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptcd3Q14C51 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptcd3Q14C51 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ptcd3Q14C51 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptcd3Q14C51 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptcd3Q14C51 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptcd3Q14C51 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ptcd3Q14C51 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptcd3Q14C51 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ptcd3Q14C51 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
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