Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc138Q0VF22 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc138Q0VF22 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc138Q0VF22 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc138Q0VF22 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc138Q0VF22 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc138Q0VF22 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc138Q0VF22 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc138Q0VF22 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc138Q0VF22 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc138Q0VF22 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc138Q0VF22 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc138Q0VF22 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc138Q0VF22 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc138Q0VF22 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc138Q0VF22 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc138Q0VF22 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc138Q0VF22 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc138Q0VF22 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc138Q0VF22 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc138Q0VF22 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc138Q0VF22 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc138Q0VF22 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc138Q0VF22 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc138Q0VF22 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc138Q0VF22 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc138Q0VF22 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc138Q0VF22 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms