Protein–RNA interactions for Protein: Q08235

BRX1, Ribosome biogenesis protein BRX1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRX1Q08235 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.52□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.52□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.52□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.52□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.52□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.52□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.52□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.52□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.52□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.52□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.52□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.52□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 PAU19YMR325W 375 nt7.52□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 HBS1YKR084C 1836 nt7.51□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 LYS20YDL182W 1287 nt7.51□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 YNL040WYNL040W 1371 nt7.5□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 YCR025CYCR025C 411 nt7.5□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 CYC3YAL039C 810 nt7.5□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 YFR020WYFR020W 699 nt7.49□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 RSM7YJR113C 744 nt7.49□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 MRS4YKR052C 915 nt7.48□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 AAC3YBR085W 924 nt7.47□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 AAT1YKL106W 1356 nt7.46□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 ECM27YJR106W 2178 nt7.46□□□□□ -1.21
BRX1Q08235 SRP102YKL154W 735 nt7.45□□□□□ -1.22
BRX1Q08235 YLR280CYLR280C 351 nt7.45□□□□□ -1.22
BRX1Q08235 TMS1YDR105C 1422 nt7.44□□□□□ -1.22
BRX1Q08235 ATO2YNR002C 849 nt7.44□□□□□ -1.22
BRX1Q08235 PUP1YOR157C 786 nt7.44□□□□□ -1.22
BRX1Q08235 FET5YFL041W 1869 nt7.43□□□□□ -1.22
BRX1Q08235 MAS2YHR024C 1449 nt7.43□□□□□ -1.22
BRX1Q08235 ERO1YML130C 1692 nt7.42□□□□□ -1.22
BRX1Q08235 ITR1YDR497C 1755 nt7.42□□□□□ -1.22
BRX1Q08235 CHA1YCL064C 1083 nt7.42□□□□□ -1.22
BRX1Q08235 SER2YGR208W 930 nt7.42□□□□□ -1.22
BRX1Q08235 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.42□□□□□ -1.22
BRX1Q08235 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.42□□□□□ -1.22
BRX1Q08235 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.42□□□□□ -1.22
BRX1Q08235 YIR035CYIR035C 765 nt7.41□□□□□ -1.22
BRX1Q08235 ATP10YLR393W 840 nt7.41□□□□□ -1.22
BRX1Q08235 TRP2YER090W 1524 nt7.41□□□□□ -1.22
BRX1Q08235 CDC13YDL220C 2775 nt7.41□□□□□ -1.22
BRX1Q08235 EMC3YKL207W 762 nt7.4□□□□□ -1.22
BRX1Q08235 YLR460CYLR460C 1131 nt7.4□□□□□ -1.22
BRX1Q08235 ADE16YLR028C 1776 nt7.4□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 YJL009WYJL009W 327 nt7.39□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 YJR149WYJR149W 1215 nt7.39□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 HTS1YPR033C 1641 nt7.38□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 snR86snR86 1004 nt7.38□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 YER152CYER152C 1332 nt7.37□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 YGR210CYGR210C 1236 nt7.37□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 BUB2YMR055C 921 nt7.37□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 SLG1YOR008C 1137 nt7.37□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 PFS2YNL317W 1398 nt7.36□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 YIL177CYIL177C 5277 nt7.36□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 HXT11YOL156W 1704 nt7.36□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 TOS2YGR221C 1869 nt7.36□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 NMD5YJR132W 3147 nt7.36□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 PRP2YNR011C 2631 nt7.35□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 DAL7YIR031C 1665 nt7.35□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 CHS7YHR142W 951 nt7.35□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 YBR056WYBR056W 1506 nt7.35□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 ASN2YGR124W 1719 nt7.35□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 HSM3YBR272C 1443 nt7.35□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 ADE17YMR120C 1779 nt7.34□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 YCP4YCR004C 744 nt7.34□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 MET22YOL064C 1074 nt7.34□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 OLA1YBR025C 1185 nt7.34□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.34□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.34□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.34□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 YLR072WYLR072W 2082 nt7.34□□□□□ -1.23
BRX1Q08235 FCP1YMR277W 2199 nt7.33□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 SAM50YNL026W 1455 nt7.33□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.33□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.33□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.33□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.33□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.33□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 SWM1YDR260C 513 nt7.32□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 RNA170RNA170 169 nt7.32□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 YMR166CYMR166C 1107 nt7.32□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 MEP1YGR121C 1479 nt7.31□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 YOS9YDR057W 1629 nt7.31□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 CIR2YOR356W 1896 nt7.31□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 YPL108WYPL108W 507 nt7.31□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 HSV2YGR223C 1347 nt7.3□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 PRC1YMR297W 1599 nt7.3□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 OCH1YGL038C 1443 nt7.3□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 YMR210WYMR210W 1350 nt7.3□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 PDC6YGR087C 1692 nt7.29□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 SRM1YGL097W 1449 nt7.29□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 YEN1YER041W 2280 nt7.29□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 CAK1YFL029C 1107 nt7.29□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 LEA1YPL213W 717 nt7.29□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 LSP1YPL004C 1026 nt7.28□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 FCY1YPR062W 477 nt7.28□□□□□ -1.24
BRX1Q08235 HIS3YOR202W 663 nt7.27□□□□□ -1.25
BRX1Q08235 snR4snR4 186 nt7.27□□□□□ -1.25
BRX1Q08235 YIP4YGL198W 708 nt7.26□□□□□ -1.25
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