Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
F13bQ07968 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
F13bQ07968 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
F13bQ07968 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
F13bQ07968 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
F13bQ07968 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
F13bQ07968 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
F13bQ07968 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
F13bQ07968 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F13bQ07968 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
F13bQ07968 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
F13bQ07968 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13bQ07968 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13bQ07968 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13bQ07968 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13bQ07968 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
F13bQ07968 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
F13bQ07968 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
F13bQ07968 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
F13bQ07968 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
F13bQ07968 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
F13bQ07968 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
F13bQ07968 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
F13bQ07968 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
F13bQ07968 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
F13bQ07968 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
F13bQ07968 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
F13bQ07968 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
F13bQ07968 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
F13bQ07968 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
F13bQ07968 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
F13bQ07968 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
F13bQ07968 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
F13bQ07968 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
F13bQ07968 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
F13bQ07968 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
F13bQ07968 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
F13bQ07968 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
F13bQ07968 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
F13bQ07968 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
F13bQ07968 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
F13bQ07968 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
F13bQ07968 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
F13bQ07968 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
F13bQ07968 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
F13bQ07968 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
F13bQ07968 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
F13bQ07968 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
F13bQ07968 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
F13bQ07968 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
F13bQ07968 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
F13bQ07968 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
F13bQ07968 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms