Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Nfe2Q07279 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nfe2Q07279 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Nfe2Q07279 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nfe2Q07279 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nfe2Q07279 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nfe2Q07279 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nfe2Q07279 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nfe2Q07279 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nfe2Q07279 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nfe2Q07279 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nfe2Q07279 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nfe2Q07279 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nfe2Q07279 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nfe2Q07279 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nfe2Q07279 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nfe2Q07279 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nfe2Q07279 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nfe2Q07279 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nfe2Q07279 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nfe2Q07279 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nfe2Q07279 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nfe2Q07279 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nfe2Q07279 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Nfe2Q07279 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nfe2Q07279 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Nfe2Q07279 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Nfe2Q07279 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nfe2Q07279 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nfe2Q07279 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nfe2Q07279 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nfe2Q07279 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Nfe2Q07279 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nfe2Q07279 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Nfe2Q07279 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nfe2Q07279 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nfe2Q07279 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nfe2Q07279 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nfe2Q07279 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nfe2Q07279 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nfe2Q07279 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nfe2Q07279 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nfe2Q07279 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nfe2Q07279 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Nfe2Q07279 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nfe2Q07279 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nfe2Q07279 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nfe2Q07279 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nfe2Q07279 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Nfe2Q07279 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nfe2Q07279 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nfe2Q07279 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nfe2Q07279 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nfe2Q07279 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nfe2Q07279 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Nfe2Q07279 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Nfe2Q07279 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nfe2Q07279 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Nfe2Q07279 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nfe2Q07279 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nfe2Q07279 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nfe2Q07279 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nfe2Q07279 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nfe2Q07279 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Nfe2Q07279 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nfe2Q07279 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nfe2Q07279 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nfe2Q07279 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nfe2Q07279 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nfe2Q07279 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nfe2Q07279 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nfe2Q07279 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nfe2Q07279 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nfe2Q07279 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nfe2Q07279 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nfe2Q07279 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nfe2Q07279 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms