Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smpd1Q04519 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Smpd1Q04519 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smpd1Q04519 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smpd1Q04519 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smpd1Q04519 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smpd1Q04519 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smpd1Q04519 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smpd1Q04519 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smpd1Q04519 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smpd1Q04519 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Smpd1Q04519 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smpd1Q04519 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Smpd1Q04519 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smpd1Q04519 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smpd1Q04519 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smpd1Q04519 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smpd1Q04519 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smpd1Q04519 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smpd1Q04519 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Smpd1Q04519 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smpd1Q04519 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smpd1Q04519 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smpd1Q04519 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Smpd1Q04519 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smpd1Q04519 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smpd1Q04519 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smpd1Q04519 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Smpd1Q04519 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smpd1Q04519 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smpd1Q04519 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smpd1Q04519 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smpd1Q04519 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smpd1Q04519 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smpd1Q04519 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smpd1Q04519 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Smpd1Q04519 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smpd1Q04519 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smpd1Q04519 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smpd1Q04519 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smpd1Q04519 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smpd1Q04519 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smpd1Q04519 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smpd1Q04519 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smpd1Q04519 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smpd1Q04519 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smpd1Q04519 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Smpd1Q04519 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smpd1Q04519 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smpd1Q04519 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smpd1Q04519 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smpd1Q04519 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Smpd1Q04519 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smpd1Q04519 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smpd1Q04519 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smpd1Q04519 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smpd1Q04519 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Smpd1Q04519 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smpd1Q04519 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smpd1Q04519 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smpd1Q04519 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smpd1Q04519 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smpd1Q04519 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smpd1Q04519 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Smpd1Q04519 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Smpd1Q04519 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smpd1Q04519 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smpd1Q04519 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Smpd1Q04519 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smpd1Q04519 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smpd1Q04519 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smpd1Q04519 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Smpd1Q04519 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smpd1Q04519 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Smpd1Q04519 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smpd1Q04519 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smpd1Q04519 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smpd1Q04519 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smpd1Q04519 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smpd1Q04519 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smpd1Q04519 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smpd1Q04519 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smpd1Q04519 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smpd1Q04519 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smpd1Q04519 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smpd1Q04519 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Smpd1Q04519 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smpd1Q04519 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Smpd1Q04519 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smpd1Q04519 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Smpd1Q04519 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smpd1Q04519 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smpd1Q04519 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smpd1Q04519 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smpd1Q04519 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smpd1Q04519 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smpd1Q04519 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smpd1Q04519 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smpd1Q04519 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smpd1Q04519 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms