Protein–RNA interactions for Protein: Q02526

Zfp41, Zinc finger protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp41Q02526 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zfp41Q02526 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp41Q02526 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zfp41Q02526 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp41Q02526 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zfp41Q02526 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp41Q02526 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp41Q02526 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp41Q02526 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp41Q02526 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp41Q02526 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zfp41Q02526 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp41Q02526 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zfp41Q02526 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zfp41Q02526 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp41Q02526 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp41Q02526 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zfp41Q02526 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp41Q02526 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp41Q02526 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zfp41Q02526 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp41Q02526 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp41Q02526 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp41Q02526 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zfp41Q02526 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp41Q02526 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp41Q02526 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp41Q02526 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zfp41Q02526 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp41Q02526 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp41Q02526 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp41Q02526 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp41Q02526 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zfp41Q02526 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zfp41Q02526 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zfp41Q02526 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp41Q02526 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp41Q02526 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp41Q02526 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp41Q02526 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp41Q02526 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp41Q02526 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp41Q02526 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp41Q02526 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp41Q02526 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp41Q02526 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp41Q02526 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp41Q02526 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp41Q02526 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp41Q02526 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp41Q02526 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp41Q02526 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp41Q02526 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp41Q02526 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp41Q02526 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp41Q02526 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp41Q02526 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp41Q02526 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp41Q02526 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp41Q02526 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zfp41Q02526 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zfp41Q02526 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zfp41Q02526 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp41Q02526 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp41Q02526 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp41Q02526 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp41Q02526 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp41Q02526 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zfp41Q02526 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp41Q02526 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp41Q02526 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zfp41Q02526 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp41Q02526 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp41Q02526 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp41Q02526 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp41Q02526 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp41Q02526 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Zfp41Q02526 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms