Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Pde4dQ01063 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Pde4dQ01063 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Pde4dQ01063 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Pde4dQ01063 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pde4dQ01063 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pde4dQ01063 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Pde4dQ01063 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pde4dQ01063 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Pde4dQ01063 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pde4dQ01063 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pde4dQ01063 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Pde4dQ01063 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pde4dQ01063 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Pde4dQ01063 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pde4dQ01063 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pde4dQ01063 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pde4dQ01063 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pde4dQ01063 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pde4dQ01063 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pde4dQ01063 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Pde4dQ01063 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pde4dQ01063 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pde4dQ01063 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pde4dQ01063 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pde4dQ01063 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pde4dQ01063 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pde4dQ01063 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pde4dQ01063 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pde4dQ01063 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pde4dQ01063 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pde4dQ01063 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Pde4dQ01063 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Pde4dQ01063 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pde4dQ01063 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Pde4dQ01063 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Pde4dQ01063 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pde4dQ01063 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pde4dQ01063 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Pde4dQ01063 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Pde4dQ01063 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pde4dQ01063 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Pde4dQ01063 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pde4dQ01063 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Pde4dQ01063 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pde4dQ01063 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pde4dQ01063 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pde4dQ01063 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pde4dQ01063 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pde4dQ01063 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Pde4dQ01063 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pde4dQ01063 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pde4dQ01063 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pde4dQ01063 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pde4dQ01063 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pde4dQ01063 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pde4dQ01063 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pde4dQ01063 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pde4dQ01063 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pde4dQ01063 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pde4dQ01063 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pde4dQ01063 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pde4dQ01063 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Pde4dQ01063 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Pde4dQ01063 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Pde4dQ01063 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pde4dQ01063 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pde4dQ01063 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pde4dQ01063 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pde4dQ01063 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pde4dQ01063 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pde4dQ01063 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pde4dQ01063 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pde4dQ01063 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pde4dQ01063 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pde4dQ01063 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pde4dQ01063 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms