Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
AlkP97793 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
AlkP97793 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
AlkP97793 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
AlkP97793 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
AlkP97793 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
AlkP97793 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
AlkP97793 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
AlkP97793 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
AlkP97793 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
AlkP97793 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
AlkP97793 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
AlkP97793 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
AlkP97793 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
AlkP97793 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
AlkP97793 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
AlkP97793 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
AlkP97793 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
AlkP97793 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
AlkP97793 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
AlkP97793 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
AlkP97793 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
AlkP97793 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
AlkP97793 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
AlkP97793 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
AlkP97793 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
AlkP97793 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
AlkP97793 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
AlkP97793 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
AlkP97793 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
AlkP97793 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
AlkP97793 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
AlkP97793 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
AlkP97793 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
AlkP97793 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
AlkP97793 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
AlkP97793 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
AlkP97793 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
AlkP97793 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
AlkP97793 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
AlkP97793 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
AlkP97793 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
AlkP97793 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
AlkP97793 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
AlkP97793 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
AlkP97793 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
AlkP97793 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
AlkP97793 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
AlkP97793 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
AlkP97793 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
AlkP97793 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
AlkP97793 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
AlkP97793 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
AlkP97793 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
AlkP97793 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
AlkP97793 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
AlkP97793 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
AlkP97793 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
AlkP97793 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
AlkP97793 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
AlkP97793 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
AlkP97793 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
AlkP97793 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
AlkP97793 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
AlkP97793 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
AlkP97793 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
AlkP97793 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
AlkP97793 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
AlkP97793 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
AlkP97793 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
AlkP97793 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
AlkP97793 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
AlkP97793 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
AlkP97793 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
AlkP97793 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
AlkP97793 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
AlkP97793 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
AlkP97793 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
AlkP97793 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
AlkP97793 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
AlkP97793 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
AlkP97793 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
AlkP97793 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
AlkP97793 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
AlkP97793 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
AlkP97793 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
AlkP97793 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
AlkP97793 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
AlkP97793 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
AlkP97793 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
AlkP97793 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
AlkP97793 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
AlkP97793 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
AlkP97793 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
AlkP97793 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
AlkP97793 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
AlkP97793 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
AlkP97793 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
AlkP97793 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
AlkP97793 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.2 ms