Protein–RNA interactions for Protein: P97333

Nrp1, Neuropilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrp1P97333 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nrp1P97333 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nrp1P97333 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nrp1P97333 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nrp1P97333 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nrp1P97333 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nrp1P97333 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Nrp1P97333 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nrp1P97333 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nrp1P97333 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nrp1P97333 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nrp1P97333 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nrp1P97333 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nrp1P97333 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nrp1P97333 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nrp1P97333 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nrp1P97333 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nrp1P97333 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nrp1P97333 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nrp1P97333 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nrp1P97333 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nrp1P97333 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nrp1P97333 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nrp1P97333 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nrp1P97333 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nrp1P97333 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nrp1P97333 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nrp1P97333 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nrp1P97333 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nrp1P97333 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nrp1P97333 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nrp1P97333 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Nrp1P97333 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nrp1P97333 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nrp1P97333 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nrp1P97333 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nrp1P97333 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nrp1P97333 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nrp1P97333 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nrp1P97333 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nrp1P97333 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nrp1P97333 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nrp1P97333 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nrp1P97333 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nrp1P97333 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nrp1P97333 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nrp1P97333 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nrp1P97333 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nrp1P97333 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nrp1P97333 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nrp1P97333 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nrp1P97333 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nrp1P97333 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nrp1P97333 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nrp1P97333 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrp1P97333 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrp1P97333 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrp1P97333 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nrp1P97333 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrp1P97333 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nrp1P97333 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrp1P97333 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrp1P97333 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrp1P97333 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrp1P97333 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nrp1P97333 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nrp1P97333 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nrp1P97333 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nrp1P97333 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nrp1P97333 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nrp1P97333 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nrp1P97333 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrp1P97333 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrp1P97333 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrp1P97333 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrp1P97333 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrp1P97333 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nrp1P97333 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrp1P97333 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrp1P97333 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrp1P97333 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nrp1P97333 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nrp1P97333 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nrp1P97333 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nrp1P97333 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nrp1P97333 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nrp1P97333 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Nrp1P97333 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nrp1P97333 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrp1P97333 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrp1P97333 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nrp1P97333 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrp1P97333 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrp1P97333 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nrp1P97333 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrp1P97333 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrp1P97333 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nrp1P97333 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrp1P97333 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nrp1P97333 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms