Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PtprvP70289 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PtprvP70289 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
PtprvP70289 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PtprvP70289 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PtprvP70289 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
PtprvP70289 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtprvP70289 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PtprvP70289 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PtprvP70289 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PtprvP70289 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
PtprvP70289 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PtprvP70289 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PtprvP70289 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PtprvP70289 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PtprvP70289 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PtprvP70289 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PtprvP70289 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprvP70289 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprvP70289 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
PtprvP70289 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PtprvP70289 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PtprvP70289 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PtprvP70289 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PtprvP70289 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PtprvP70289 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PtprvP70289 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PtprvP70289 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PtprvP70289 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprvP70289 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PtprvP70289 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
PtprvP70289 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PtprvP70289 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
PtprvP70289 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
PtprvP70289 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
PtprvP70289 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
PtprvP70289 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PtprvP70289 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
PtprvP70289 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprvP70289 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PtprvP70289 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PtprvP70289 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PtprvP70289 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
PtprvP70289 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PtprvP70289 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PtprvP70289 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PtprvP70289 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
PtprvP70289 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PtprvP70289 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PtprvP70289 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
PtprvP70289 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PtprvP70289 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PtprvP70289 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PtprvP70289 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PtprvP70289 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PtprvP70289 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PtprvP70289 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PtprvP70289 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PtprvP70289 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PtprvP70289 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PtprvP70289 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PtprvP70289 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PtprvP70289 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PtprvP70289 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PtprvP70289 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PtprvP70289 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PtprvP70289 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PtprvP70289 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PtprvP70289 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PtprvP70289 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
PtprvP70289 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PtprvP70289 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PtprvP70289 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PtprvP70289 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PtprvP70289 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PtprvP70289 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprvP70289 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprvP70289 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprvP70289 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PtprvP70289 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PtprvP70289 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PtprvP70289 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PtprvP70289 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PtprvP70289 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
PtprvP70289 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PtprvP70289 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PtprvP70289 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PtprvP70289 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PtprvP70289 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PtprvP70289 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PtprvP70289 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PtprvP70289 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PtprvP70289 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PtprvP70289 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PtprvP70289 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PtprvP70289 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms