Protein–RNA interactions for Protein: P70206

Plxna1, Plexin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 1,894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna1P70206 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Plxna1P70206 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Plxna1P70206 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plxna1P70206 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Plxna1P70206 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxna1P70206 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxna1P70206 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxna1P70206 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxna1P70206 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxna1P70206 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Plxna1P70206 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Plxna1P70206 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Plxna1P70206 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Plxna1P70206 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Plxna1P70206 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Plxna1P70206 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Plxna1P70206 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Plxna1P70206 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxna1P70206 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxna1P70206 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxna1P70206 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Plxna1P70206 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Plxna1P70206 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Plxna1P70206 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Plxna1P70206 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Plxna1P70206 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Plxna1P70206 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Plxna1P70206 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Plxna1P70206 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Plxna1P70206 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Plxna1P70206 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Plxna1P70206 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Plxna1P70206 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Plxna1P70206 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Plxna1P70206 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Plxna1P70206 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Plxna1P70206 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Plxna1P70206 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Plxna1P70206 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Plxna1P70206 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Plxna1P70206 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Plxna1P70206 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Plxna1P70206 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plxna1P70206 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plxna1P70206 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plxna1P70206 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plxna1P70206 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plxna1P70206 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Plxna1P70206 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Plxna1P70206 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Plxna1P70206 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Plxna1P70206 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Plxna1P70206 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Plxna1P70206 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Plxna1P70206 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Plxna1P70206 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Plxna1P70206 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Plxna1P70206 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Plxna1P70206 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Plxna1P70206 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Plxna1P70206 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Plxna1P70206 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Plxna1P70206 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Plxna1P70206 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Plxna1P70206 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Plxna1P70206 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Plxna1P70206 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Plxna1P70206 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Plxna1P70206 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Plxna1P70206 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Plxna1P70206 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Plxna1P70206 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Plxna1P70206 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms