Protein–RNA interactions for Protein: P68368

Tuba4a, Tubulin alpha-4A chain, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba4aP68368 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tuba4aP68368 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tuba4aP68368 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tuba4aP68368 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tuba4aP68368 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tuba4aP68368 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tuba4aP68368 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tuba4aP68368 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tuba4aP68368 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tuba4aP68368 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tuba4aP68368 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Tuba4aP68368 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tuba4aP68368 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tuba4aP68368 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tuba4aP68368 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tuba4aP68368 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tuba4aP68368 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tuba4aP68368 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tuba4aP68368 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tuba4aP68368 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tuba4aP68368 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tuba4aP68368 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tuba4aP68368 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tuba4aP68368 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tuba4aP68368 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tuba4aP68368 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tuba4aP68368 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tuba4aP68368 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tuba4aP68368 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tuba4aP68368 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tuba4aP68368 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tuba4aP68368 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tuba4aP68368 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tuba4aP68368 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tuba4aP68368 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tuba4aP68368 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tuba4aP68368 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tuba4aP68368 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tuba4aP68368 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tuba4aP68368 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms