Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SnrpeP62305 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SnrpeP62305 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SnrpeP62305 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SnrpeP62305 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SnrpeP62305 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SnrpeP62305 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SnrpeP62305 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SnrpeP62305 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SnrpeP62305 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SnrpeP62305 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SnrpeP62305 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SnrpeP62305 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SnrpeP62305 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SnrpeP62305 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
SnrpeP62305 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
SnrpeP62305 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SnrpeP62305 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SnrpeP62305 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SnrpeP62305 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SnrpeP62305 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms