Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tdrd6P61407 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tdrd6P61407 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tdrd6P61407 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tdrd6P61407 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd6P61407 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tdrd6P61407 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd6P61407 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tdrd6P61407 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tdrd6P61407 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tdrd6P61407 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tdrd6P61407 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tdrd6P61407 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tdrd6P61407 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tdrd6P61407 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tdrd6P61407 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tdrd6P61407 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tdrd6P61407 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tdrd6P61407 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tdrd6P61407 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tdrd6P61407 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd6P61407 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd6P61407 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd6P61407 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tdrd6P61407 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tdrd6P61407 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tdrd6P61407 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tdrd6P61407 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tdrd6P61407 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tdrd6P61407 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tdrd6P61407 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tdrd6P61407 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tdrd6P61407 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tdrd6P61407 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tdrd6P61407 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd6P61407 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd6P61407 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tdrd6P61407 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tdrd6P61407 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tdrd6P61407 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tdrd6P61407 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tdrd6P61407 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tdrd6P61407 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tdrd6P61407 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tdrd6P61407 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tdrd6P61407 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tdrd6P61407 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tdrd6P61407 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tdrd6P61407 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tdrd6P61407 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tdrd6P61407 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tdrd6P61407 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tdrd6P61407 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tdrd6P61407 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tdrd6P61407 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd6P61407 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd6P61407 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd6P61407 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tdrd6P61407 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tdrd6P61407 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tdrd6P61407 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tdrd6P61407 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tdrd6P61407 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd6P61407 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd6P61407 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd6P61407 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd6P61407 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd6P61407 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd6P61407 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tdrd6P61407 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tdrd6P61407 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd6P61407 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd6P61407 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd6P61407 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd6P61407 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd6P61407 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd6P61407 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd6P61407 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd6P61407 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd6P61407 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd6P61407 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd6P61407 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118 ms