Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm2aP59997 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Kdm2aP59997 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm2aP59997 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Kdm2aP59997 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm2aP59997 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm2aP59997 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Kdm2aP59997 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm2aP59997 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Kdm2aP59997 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm2aP59997 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm2aP59997 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Kdm2aP59997 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Kdm2aP59997 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Kdm2aP59997 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Kdm2aP59997 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Kdm2aP59997 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Kdm2aP59997 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Kdm2aP59997 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Kdm2aP59997 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Kdm2aP59997 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Kdm2aP59997 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm2aP59997 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm2aP59997 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm2aP59997 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Kdm2aP59997 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
Kdm2aP59997 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Kdm2aP59997 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Kdm2aP59997 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm2aP59997 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Kdm2aP59997 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm2aP59997 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm2aP59997 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm2aP59997 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Kdm2aP59997 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm2aP59997 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Kdm2aP59997 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Kdm2aP59997 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Kdm2aP59997 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Kdm2aP59997 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Kdm2aP59997 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Kdm2aP59997 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Kdm2aP59997 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Kdm2aP59997 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Kdm2aP59997 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Kdm2aP59997 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Kdm2aP59997 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Kdm2aP59997 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm2aP59997 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Kdm2aP59997 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Kdm2aP59997 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Kdm2aP59997 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Kdm2aP59997 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm2aP59997 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm2aP59997 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Kdm2aP59997 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Kdm2aP59997 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Kdm2aP59997 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm2aP59997 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm2aP59997 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Kdm2aP59997 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm2aP59997 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Kdm2aP59997 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Kdm2aP59997 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Kdm2aP59997 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Kdm2aP59997 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Kdm2aP59997 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Kdm2aP59997 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm2aP59997 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm2aP59997 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm2aP59997 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Kdm2aP59997 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm2aP59997 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm2aP59997 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Kdm2aP59997 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Kdm2aP59997 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms