Protein–RNA interactions for Protein: P59034

Lrrc3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc3P59034 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc3P59034 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc3P59034 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc3P59034 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc3P59034 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrrc3P59034 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc3P59034 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc3P59034 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc3P59034 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc3P59034 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrc3P59034 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrc3P59034 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc3P59034 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc3P59034 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc3P59034 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc3P59034 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrc3P59034 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc3P59034 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc3P59034 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc3P59034 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc3P59034 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc3P59034 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc3P59034 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc3P59034 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc3P59034 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc3P59034 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc3P59034 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc3P59034 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc3P59034 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc3P59034 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc3P59034 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc3P59034 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrrc3P59034 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrrc3P59034 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc3P59034 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc3P59034 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrrc3P59034 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrrc3P59034 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc3P59034 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc3P59034 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc3P59034 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc3P59034 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc3P59034 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrrc3P59034 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc3P59034 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrrc3P59034 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc3P59034 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc3P59034 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc3P59034 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrrc3P59034 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc3P59034 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc3P59034 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc3P59034 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrrc3P59034 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc3P59034 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc3P59034 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc3P59034 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc3P59034 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc3P59034 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc3P59034 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc3P59034 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc3P59034 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc3P59034 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc3P59034 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc3P59034 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc3P59034 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc3P59034 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc3P59034 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc3P59034 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrrc3P59034 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc3P59034 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms