Protein–RNA interactions for Protein: P56542

Dnase2, Deoxyribonuclease-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnase2P56542 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Dnase2P56542 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnase2P56542 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Dnase2P56542 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Dnase2P56542 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms