Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CartptP56388 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CartptP56388 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CartptP56388 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CartptP56388 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CartptP56388 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CartptP56388 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CartptP56388 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CartptP56388 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CartptP56388 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CartptP56388 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CartptP56388 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CartptP56388 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CartptP56388 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CartptP56388 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CartptP56388 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CartptP56388 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CartptP56388 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CartptP56388 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CartptP56388 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CartptP56388 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CartptP56388 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CartptP56388 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CartptP56388 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CartptP56388 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CartptP56388 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CartptP56388 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CartptP56388 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CartptP56388 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CartptP56388 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CartptP56388 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CartptP56388 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CartptP56388 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CartptP56388 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CartptP56388 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CartptP56388 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CartptP56388 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CartptP56388 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CartptP56388 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CartptP56388 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CartptP56388 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CartptP56388 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CartptP56388 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CartptP56388 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CartptP56388 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CartptP56388 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CartptP56388 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CartptP56388 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CartptP56388 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CartptP56388 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CartptP56388 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CartptP56388 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CartptP56388 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CartptP56388 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CartptP56388 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CartptP56388 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CartptP56388 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CartptP56388 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CartptP56388 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CartptP56388 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CartptP56388 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CartptP56388 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CartptP56388 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CartptP56388 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CartptP56388 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CartptP56388 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CartptP56388 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CartptP56388 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CartptP56388 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CartptP56388 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CartptP56388 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CartptP56388 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CartptP56388 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CartptP56388 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CartptP56388 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CartptP56388 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CartptP56388 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CartptP56388 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CartptP56388 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CartptP56388 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CartptP56388 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CartptP56388 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CartptP56388 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CartptP56388 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CartptP56388 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CartptP56388 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CartptP56388 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CartptP56388 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CartptP56388 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CartptP56388 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CartptP56388 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CartptP56388 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CartptP56388 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CartptP56388 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CartptP56388 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CartptP56388 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CartptP56388 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CartptP56388 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CartptP56388 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CartptP56388 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
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