Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CnbpP53996 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CnbpP53996 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CnbpP53996 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CnbpP53996 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CnbpP53996 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CnbpP53996 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CnbpP53996 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CnbpP53996 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CnbpP53996 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CnbpP53996 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CnbpP53996 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CnbpP53996 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CnbpP53996 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CnbpP53996 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CnbpP53996 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CnbpP53996 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CnbpP53996 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CnbpP53996 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CnbpP53996 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CnbpP53996 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CnbpP53996 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CnbpP53996 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnbpP53996 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnbpP53996 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CnbpP53996 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CnbpP53996 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CnbpP53996 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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