Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Fgd1P52734 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Fgd1P52734 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fgd1P52734 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fgd1P52734 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fgd1P52734 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fgd1P52734 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Fgd1P52734 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Fgd1P52734 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Fgd1P52734 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Fgd1P52734 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Fgd1P52734 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fgd1P52734 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Fgd1P52734 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Fgd1P52734 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Fgd1P52734 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Fgd1P52734 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fgd1P52734 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fgd1P52734 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Fgd1P52734 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Fgd1P52734 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Fgd1P52734 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Fgd1P52734 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Fgd1P52734 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fgd1P52734 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Fgd1P52734 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Fgd1P52734 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Fgd1P52734 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Fgd1P52734 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Fgd1P52734 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Fgd1P52734 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Fgd1P52734 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Fgd1P52734 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Fgd1P52734 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Fgd1P52734 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fgd1P52734 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Fgd1P52734 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fgd1P52734 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Fgd1P52734 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fgd1P52734 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fgd1P52734 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fgd1P52734 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fgd1P52734 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fgd1P52734 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Fgd1P52734 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fgd1P52734 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Fgd1P52734 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Fgd1P52734 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Fgd1P52734 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Fgd1P52734 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Fgd1P52734 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fgd1P52734 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fgd1P52734 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Fgd1P52734 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fgd1P52734 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fgd1P52734 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Fgd1P52734 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fgd1P52734 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Fgd1P52734 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Fgd1P52734 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fgd1P52734 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fgd1P52734 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Fgd1P52734 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fgd1P52734 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fgd1P52734 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fgd1P52734 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Fgd1P52734 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fgd1P52734 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Fgd1P52734 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Fgd1P52734 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fgd1P52734 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Fgd1P52734 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Fgd1P52734 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fgd1P52734 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Fgd1P52734 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fgd1P52734 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fgd1P52734 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Fgd1P52734 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fgd1P52734 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fgd1P52734 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fgd1P52734 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Fgd1P52734 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fgd1P52734 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fgd1P52734 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Fgd1P52734 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fgd1P52734 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fgd1P52734 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fgd1P52734 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fgd1P52734 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Fgd1P52734 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fgd1P52734 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fgd1P52734 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fgd1P52734 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Fgd1P52734 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Fgd1P52734 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Fgd1P52734 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fgd1P52734 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fgd1P52734 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Fgd1P52734 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Fgd1P52734 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms