Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csrp3P50462 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csrp3P50462 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csrp3P50462 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csrp3P50462 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csrp3P50462 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csrp3P50462 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csrp3P50462 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Csrp3P50462 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csrp3P50462 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csrp3P50462 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csrp3P50462 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csrp3P50462 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csrp3P50462 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csrp3P50462 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csrp3P50462 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csrp3P50462 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csrp3P50462 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csrp3P50462 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csrp3P50462 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrp3P50462 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrp3P50462 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csrp3P50462 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Csrp3P50462 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csrp3P50462 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csrp3P50462 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrp3P50462 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrp3P50462 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csrp3P50462 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csrp3P50462 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csrp3P50462 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csrp3P50462 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Csrp3P50462 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csrp3P50462 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Csrp3P50462 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csrp3P50462 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csrp3P50462 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csrp3P50462 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csrp3P50462 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csrp3P50462 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csrp3P50462 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csrp3P50462 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csrp3P50462 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csrp3P50462 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Csrp3P50462 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Csrp3P50462 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Csrp3P50462 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csrp3P50462 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms