Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmod1P49813 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmod1P49813 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmod1P49813 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmod1P49813 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmod1P49813 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmod1P49813 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmod1P49813 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmod1P49813 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmod1P49813 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmod1P49813 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmod1P49813 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmod1P49813 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmod1P49813 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmod1P49813 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmod1P49813 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmod1P49813 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmod1P49813 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmod1P49813 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmod1P49813 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmod1P49813 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmod1P49813 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmod1P49813 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tmod1P49813 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmod1P49813 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tmod1P49813 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmod1P49813 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmod1P49813 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmod1P49813 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmod1P49813 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmod1P49813 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmod1P49813 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmod1P49813 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmod1P49813 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmod1P49813 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmod1P49813 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmod1P49813 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmod1P49813 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmod1P49813 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmod1P49813 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmod1P49813 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmod1P49813 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmod1P49813 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmod1P49813 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmod1P49813 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmod1P49813 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmod1P49813 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmod1P49813 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmod1P49813 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmod1P49813 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmod1P49813 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tmod1P49813 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tmod1P49813 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmod1P49813 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmod1P49813 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmod1P49813 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmod1P49813 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmod1P49813 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmod1P49813 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tmod1P49813 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmod1P49813 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmod1P49813 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tmod1P49813 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmod1P49813 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmod1P49813 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tmod1P49813 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tmod1P49813 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmod1P49813 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tmod1P49813 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmod1P49813 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tmod1P49813 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tmod1P49813 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmod1P49813 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmod1P49813 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmod1P49813 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmod1P49813 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmod1P49813 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmod1P49813 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmod1P49813 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tmod1P49813 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmod1P49813 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmod1P49813 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmod1P49813 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmod1P49813 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmod1P49813 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmod1P49813 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmod1P49813 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tmod1P49813 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmod1P49813 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmod1P49813 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmod1P49813 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmod1P49813 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmod1P49813 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmod1P49813 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmod1P49813 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmod1P49813 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmod1P49813 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmod1P49813 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmod1P49813 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tmod1P49813 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
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