Protein–RNA interactions for Protein: P49312

Hnrnpa1, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnrnpa1P49312 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hnrnpa1P49312 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hnrnpa1P49312 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hnrnpa1P49312 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hnrnpa1P49312 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hnrnpa1P49312 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hnrnpa1P49312 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hnrnpa1P49312 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hnrnpa1P49312 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hnrnpa1P49312 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hnrnpa1P49312 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hnrnpa1P49312 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hnrnpa1P49312 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hnrnpa1P49312 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hnrnpa1P49312 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hnrnpa1P49312 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hnrnpa1P49312 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hnrnpa1P49312 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hnrnpa1P49312 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hnrnpa1P49312 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hnrnpa1P49312 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hnrnpa1P49312 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hnrnpa1P49312 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hnrnpa1P49312 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hnrnpa1P49312 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hnrnpa1P49312 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hnrnpa1P49312 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hnrnpa1P49312 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hnrnpa1P49312 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hnrnpa1P49312 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hnrnpa1P49312 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hnrnpa1P49312 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hnrnpa1P49312 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hnrnpa1P49312 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hnrnpa1P49312 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hnrnpa1P49312 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hnrnpa1P49312 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hnrnpa1P49312 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hnrnpa1P49312 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hnrnpa1P49312 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hnrnpa1P49312 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hnrnpa1P49312 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hnrnpa1P49312 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hnrnpa1P49312 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hnrnpa1P49312 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hnrnpa1P49312 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hnrnpa1P49312 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hnrnpa1P49312 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hnrnpa1P49312 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Hnrnpa1P49312 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hnrnpa1P49312 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hnrnpa1P49312 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hnrnpa1P49312 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hnrnpa1P49312 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hnrnpa1P49312 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hnrnpa1P49312 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hnrnpa1P49312 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hnrnpa1P49312 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hnrnpa1P49312 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hnrnpa1P49312 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hnrnpa1P49312 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hnrnpa1P49312 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hnrnpa1P49312 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hnrnpa1P49312 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Hnrnpa1P49312 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hnrnpa1P49312 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hnrnpa1P49312 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hnrnpa1P49312 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hnrnpa1P49312 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hnrnpa1P49312 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hnrnpa1P49312 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hnrnpa1P49312 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hnrnpa1P49312 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hnrnpa1P49312 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hnrnpa1P49312 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hnrnpa1P49312 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hnrnpa1P49312 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hnrnpa1P49312 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hnrnpa1P49312 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms