Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptx3P48759 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptx3P48759 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptx3P48759 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ptx3P48759 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptx3P48759 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptx3P48759 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ptx3P48759 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptx3P48759 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptx3P48759 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ptx3P48759 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptx3P48759 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptx3P48759 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptx3P48759 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptx3P48759 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ptx3P48759 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptx3P48759 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ptx3P48759 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptx3P48759 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptx3P48759 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptx3P48759 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ptx3P48759 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ptx3P48759 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptx3P48759 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptx3P48759 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ptx3P48759 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptx3P48759 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptx3P48759 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptx3P48759 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptx3P48759 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ptx3P48759 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptx3P48759 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ptx3P48759 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptx3P48759 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ptx3P48759 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptx3P48759 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ptx3P48759 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptx3P48759 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptx3P48759 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptx3P48759 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptx3P48759 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptx3P48759 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptx3P48759 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptx3P48759 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptx3P48759 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptx3P48759 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptx3P48759 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptx3P48759 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptx3P48759 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptx3P48759 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ptx3P48759 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms